为给学生个性化学习提供良好的环境，浦东新区教育局明确提出了学校创新实验室“一校一特色”的建设思路，坚持以创新实验室为平台，以培养学生创新能力为目的，着力加强学校创新文化培育、课程设置、课时安排、素质评价等方面系统配套的改革和设计，初步探索形成了一条独具特色的学校创新实验室特色化发展道路。
一是全局规划，整体推进创新实验室工作开展。2014年初，浦东新区教育局制定印发了《推进浦东新区高中创新实验室建设的实施方案》，从指导思想、建设目标、内涵阐述、实施工作、实施策略、实施保障等六个方面，对各校的创新实验室建设提出了指导性要求。同时，制订全区创新实验室建设的工作计划，指导区域内各校也根据区教育局统一要求，同步制订创新实验室建设方案、课程开发方案、年度工作计划等。
二是规范管理，确保创新实验室有序发展。区教育局制定《浦东新区高中创新实验室建设和管理意见》，明确要求学校根据文件在创新实验室设施建设、课程开发、课程实施、教师培训等领域内进行创新改革，形成学校特色；制定《浦东新区创新实验室建设与运行评估指标体系》，从机制保障、课程建设、师资队伍、环境布局、运行管理、特色创新等六个方面，对各校创新实验室的建设和运行进行全方位评估，促进健康发展。比如，区教师发展中心每学期组织一次全区性创新实验室现场会或专家报告会，每年组织一次由学科专家组成的项目检查小组，对每所学校进行全面评估、指导；教师发展中心项目组每学期进行一次小结，年末进行一次总结；建立了“浦东创新教育”网站，并由专职教师负责日常管理和维护，通过网络手段加强对各校创新实验室建设管理、活动交流、成果展示。
目前，区域内各校均成立了创新实验室组织机构和工作机构，制订创新实验室管理制度，初步建立创新实验室运行有效机制。比如北蔡中学建立了《航海教育馆管理细则》，建平中学建立了《基于课程的中小学创新实验室的建设与运行机制》，洋泾中学建立了《创新实验室安全操作规则》《创新实验室安全应急预案》，南汇中学制订了《创新实验室五年发展规划》，东昌中学制订了《创新实验室系列管理制度》。
三是彰显特色，各校创新实验室课程有效实施。为避免重复建设，区教育局按照“一校一特色”的思路，紧密结合高中学校的特色建设推进各高中创新实验室的建设。2014年，各校研发和实施了一批具有区域特点学校特色的创新课程，满足不同学生需求，为周边学校学生提供资源共享，使学校创新实验室成为区或市的研究、实践、体验的中心。比如北蔡中学致力于校本特色课程的开发，研发了“人与航海”课程体系，凸显航海文化教育特色；进才中学按照“科艺交融”“人文固本”的要求，将学校的创新实验室项目整合为“科艺”特色创新实验室课程；东昌中学开设了丰富的金融系列课程，为学生个性化学习及学生社团活动提供了丰富的金融资源，更为周边学校学生的“一日金融人”活动提供实践平台；大团中学开展了由校长领衔的“高中海洋文化教育课程建设”项目研究，用心打造海洋教育特色；南汇中学研发了中学阶段天文科技教育中一个比较完备的课程体系，其天文特色课程被编入2013年《创新：实验室里的时代脉动——高中创新实验室案例撷英》。